Родился 18 января 1972 года в городе Bakersfield, штат Калифорния. Его отец - владелец магазина по продаже музыкальных инструментов, а также небольшой звукозаписывающей студии - всячески способствовал развитию сына как музыканта. Поэтому с детства Джонатан изучал классику, в пять лет научился играть на барабанах, а потом стал волынщиком и даже получил медаль на фестивале Шотландской музыки. У Джонатана есть две волынки, одну из них ему подарил дед, а другую Дэвис купил сам. Кстати этот инструмент очень хорошо вписался в звучание Korn, например в композициях "Shoots and ladders", "My gift to you" и "Dead". До группы Korn Джонатан непродолжительно входил в состав группы Sex Art. Когда парень окончил школу, он решил устроиться на работу ассистентом в местный морг. "Я подумал, что это круто - каждый день видеть и резать мертвые тела. Никогда не забуду тот звук, который издает скальпель при вскрытии..." (J.Davis) Такая работа сильно повлияла на его мировоззрение, которое очень откровенно раскрыто в текстах Korn. Ещё Джонатан Дэвис косвенным образом рекламирует продукцию спортивной фирмы ADIDAS, поскольку предпочитает носить одежду с их символикой. Денег от фирмы ADIDAS он не получает, но фирма стабильно снабжает Джонатана своими новыми моделями спортивной одежды и обуви. Дэвис даже написал песню под названием A.D.I.D.A.S. Песня тоже не имеет прямого отношения к фирме. Это аббревиатура от "All day I dream about sex" (Весь день я думаю о сексе). У него есть татуировка на руке, "HIV" или "ВИЧ". Это прозвище Джонатана, которое, по его словам, не имеет никакого отношения ни к одноименному вирусу, ни к СПИДу да и слухи о том, что Джонатан ВИЧ - инфицированный - это всего лишь слухи. Он живет с сыном, которого зовут Nathan Houseman Davis и с подругой.
